绷带男(Ishmael)就是真的Big Boss。
Venom Snake真实身份是《原爆点》里在直升机治疗Paz的医疗兵，替Big Boss挡了一炸。山猫和米勒都知道其身份，受Big Boss之托协助Venom Snake。
序章里被火烧掉下楼的女兵就是静静，有个神秘说法是：静静和Venom Snake关系是成熟的互相敬仰，而不是男女之情。后来独自走掉了。
火男身边漂浮的正太就是意念螳螂。
ELI(白曼巴)就是Liquid Snake，后面在意念螳螂帮助下携带Metal Gear和母基地上的小孩跑到一个小岛上，最后和钻石狗大战失败，被意念螳螂救走。
火男就是是《潜龙谍影3》的Volgin，被意念螳螂操控。
下面视频是结局CG，注意视频里有个地方翻译错误：Venom Snake看照片背面时，John Doe错翻为“约翰 多伊”。喜欢看侦探电影都知道，John Doe是指身份不明的人。所以从始至终Venom Snake的真名都不得而知。
真结局视频：点击进入
